Фамилия Мачинин образована по простой и распространённой модели: к основе, оканчивающейся на согласный, добавили суффикс -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность — «чей?», «сын кого?». В русских фамилиях -ин обычно закреплялся за теми, чья основа заканчивалась на -а или -я (сын Ивана — Иванов, сын Мызы — Мызин), но в случае с Мачининым основа, скорее всего, звучала как Мачина, Мачиня или Мачин. То есть фамилия изначально отвечала на вопрос: «Чей будешь?» — Мачинин, то есть потомок человека по прозвищу или имени Мачина.

Корень «мач-» отсылает к слову «мачта». Прозвище Мачина могли дать высокому, долговязому человеку, которого сравнивали с мачтой — прямой и длинной. В русских говорах слово «мачта» известно с петровских времён, но прозвище могло появиться и раньше, в среде плотников, корабелов или людей, живших на реках и морях. Вторая, менее очевидная версия: основа от диалектного «мач» или «мача» — так в некоторых регионах называли рыболовную снасть или жердь для сушки сетей. Тогда прозвище относилось к рыбаку или человеку, связанному с промыслом на воде.

Есть и третий вариант, более редкий: в южнорусских и украинских говорах «мача» — это мокрая, сырая погода или топкое место. Прозвище Мачина могло характеризовать человека угрюмого, «мокрого» по характеру или жившего на болотистой земле. Однако эта версия менее убедительна: фамилия Мачинин не встречается массово в южных регионах, её география скорее северная и центральная — Вологодчина, Архангельская область, Поволжье. Именно там были развиты речное судоходство и лесосплав, где слово «мачта» было на слуху.

Фамилия недворянская, типично крестьянская или мещанская. Суффикс -ин указывает на происхождение из среды, где фамилии давали по отцу или прозвищу главы семьи, а не по месту жительства или профессии в чистом виде. В переписных книгах XVII–XVIII веков Мачинины, вероятно, записаны как «Мачинины дети» — без сословного статуса, просто как люди, чей предок носил прозвище Мачина. Со временем прозвище забылось, а фамилия закрепилась и дошла до наших дней без изменений.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Мачтов, Мачнев, Мачков, — то Мачинин стоит особняком: он образован не от прямого названия предмета, а от прозвища, которое это название переосмыслило. В этом смысле фамилия хранит не столько профессию, сколько внешнюю или поведенческую характеристику предка.