Фамилия Маёркина — вариант женского рода от мужской формы Маёркин. В русской традиции фамилии на -ин образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я, что указывает на прозвищное или профессиональное происхождение. Основа здесь — «маёрка», и это ключ к разгадке.

Самое вероятное объяснение: «маёрка» — диалектное или просторечное производное от слова «майор». В русских говорах, особенно на юге и в центральных областях, воинские звания нередко переделывали на бытовой лад: «маёр» вместо «майор», отсюда и «маёрка» — жена майора, женщина из семьи майора, или же прозвище человека, чем-то напоминавшего майора (например, важной осанкой или склонностью к командованию). Суффикс -к- в этом слове носил уменьшительно-пренебрежительный или, наоборот, бытовой оттенок, как в «солдатка», «офицерка».

Менее распространённая, но допустимая версия связывает фамилию с топонимом. В некоторых регионах России встречаются деревни с названием Маёрки или Маёровка (от того же «майор» — владельческие земли). Тогда Маёркин — это «выходец из Маёрок», а фамилия могла закрепиться за переселенцами.

Встречаемость фамилии невысокая, что типично для прозвищных фамилий, не попавших в массовые списки дворянства или купечества. Скорее всего, предки носителей фамилии Маёркина были либо военными невысокого ранга (в XVIII–XIX веках майор — штаб-офицерский чин, но не высшая знать), либо крестьянами, получившими прозвище от односельчан. В словаре Б. Унбегауна аналогичные модели (типа «Полковников», «Капитанов») описаны как типичные для сословий, где военная служба была распространена, но не давала наследственного дворянства.

Таким образом, фамилия Маёркина несёт в себе отпечаток военного быта или местной географии, и её корень — в живом народном произношении, а не в книжном стандарте.