Фамилия Маер — один из вариантов немецкой фамилии Майер (Meyer), которая в свою очередь происходит от слова Meier. В сословном обществе средневековой Германии так называли не просто фермера или арендатора, а человека, управлявшего чужим хозяйством: управляющего имением, старосту деревни или бургомистра. В некоторых диалектах слово могло означать и «каменщика», но это значение встречается реже. Таким образом, фамилия Маер — классическое «профессиональное» именование, которое прямо указывало на занятие предка.

Важно, что написание «Маер» вместо привычного «Майер» — не ошибка, а отражение особенностей произношения в разных немецких говорах. В южнонемецких диалектах и в австрийском варианте немецкого языка дифтонг «ei» звучит ближе к долгому «а», что на письме могли передавать через «ае». Поэтому фамилия Маер чаще встречается у выходцев из южных земель Германии, Австрии или Швейцарии, тогда как «Майер» более типична для севера и центра.

В России фамилия Маер закрепилась в среде поволжских немцев, которые массово переселялись в империю в XVIII–XIX веках. В документах колоний фамилия фигурирует именно в таком написании. Со временем она обрусела, но сохранила свою профессиональную основу: предки носителя фамилии Маер были людьми, отвечавшими за порядок и хозяйство на вверенной им земле.