Фамилия Матеркина образована от прозвища Матерка, и её происхождение не связано с современным бранным значением этого слова. В русских говорах «матерка» — это конопляное семя, а также ткань из конопляного волокна, грубое полотно. Прозвище Матерка могли дать крестьянину, который сеял коноплю, торговал семенем или ткал из конопли. В некоторых диалектах «матеркой» называли и бранную, сквернословящую женщину, но это значение вторично и менее вероятно для устойчивого прозвища, которое легло в основу фамилии.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Матеркин — сын Матерки, то есть член семьи человека с таким прозвищем. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от слов женского рода (ср. Княгинин, Синицын). Встречается вариант Матерков — с суффиксом -ов, что говорит о возможной путанице при записи или о происхождении от мужской формы Матерок.

Географически фамилия чаще фиксируется в центральных областях России, особенно в бывших губерниях, где было развито льноводство и коноплеводство: Тверской, Смоленской, Ярославской. Встречается и на Урале, куда переселенцы принесли прозвище вместе с ремеслом. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Матерка — это был нейтральный бытовой термин, а не оскорбление.

В словаре Б. Унбегауна фамилия не упоминается, но она хорошо вписывается в его классификацию «профессиональных» прозвищ от названий растений и продуктов их переработки. Если ваш предок носил фамилию Матеркин, скорее всего, он был связан с выращиванием конопли или изготовлением грубой ткани — занятием, которое в старину кормило множество деревенских семей.