Фамилия Магалюс — редкая и неочевидная для русского уха. Её форма сразу наводит на мысль об иноязычном происхождении: окончание -ус нетипично для славянских фамилий. В русской ономастике такие фамилии чаще всего оказываются полонизмами или литуанизмами — то есть пришли из польского или литовского языков.

Скорее всего, Магалюс — это русифицированная форма литовской фамилии Magalius или польskiej Magalusz. В основе лежит литовское слово magalas — «обрубок», «чурбан», «колода». Прозвище Магалюс могли дать человеку крепкого, коренастого телосложения, либо, в переносном смысле, медлительному и неповоротливому. В польском языке встречается сходное maglować (от нем. mangeln) — «катать бельё», «гладить», но это скорее профессиональное прозвище для валяльщика сукна или прачки, работавшей с катком (маглем). Обе версии имеют право на существование, но первая — с «обрубком» — более вероятна, так как фамилии на -ус чаще образуются от литовских корней, а не от польских глаголов.

Суффикс -ус в литовских фамилиях — это типичное окончание именительного падежа (как в фамилиях Мажюлис, Будрис). При переходе в русскую среду окончание сохранили, но адаптировали ударение. Встречается Магалюс в западных регионах бывшей Российской империи — на территории современной Литвы, Беларуси и в пограничных областях Польши. В России фамилия крайне редка, встречается единичными вкраплениями, вероятно, у потомков переселенцев конца XIX — начала XX века.

Социальный состав носителей, судя по географии, — крестьяне или мелкая шляхта. В Литве и Беларуси фамилии на -ус часто носили литовские крестьяне, получившие их при отмене крепостного права. Однако не исключено, что часть Магалюсов принадлежала к обедневшей шляхте, которая сохраняла старые родовые прозвища. Точных данных о дворянских гербах с этой фамилией нет.

В написании возможны варианты: Магалюс, Магалюсь (с мягким знаком на конце — под влиянием белорусской или польской орфографии), а также Магалюсас — более полная литовская форма. Если ваши предки писали фамилию через «ё» (Магалёс), это могло быть результатом случайной описки или местного произношения.