Фамилия Магассумова — женская форма фамилии Магассумов, которая почти наверняка образована от мужского имени Магассум. Это имя — одна из диалектных или бытовых форм арабского имени Мухаммад (Магомед, Магоммад), широко распространённого у народов, исповедующих ислам, в частности у татар, башкир и народов Кавказа. В тюркских языках имя могло звучать как «Магасум» или «Магассум», где удвоение «с» — особенность произношения или записи.

Модель образования типична для русских фамилий, возникших в среде крещёных или просто контактировавших с русской культурой народов: к основе имени добавляется патронимический суффикс -ов/-ев. Суффикс -а (-ова) в женской форме указывает на принадлежность к роду (жена или дочь Магассума). Само имя Магассум в переводе с арабского означает «защищённый», «оберегаемый» (от корня «асама» — защищать), что даёт фамилии благородный оттенок — предок мог быть человеком, находящимся под особым покровительством, либо это было распространённое личное имя, ничего не говорившее о статусе.

Географически фамилия редкая и тяготеет к регионам с татарским или башкирским населением, а также к Дагестану, где встречаются однокоренные варианты (Магомедсумов, Магасумов). В отличие от массовых фамилий на -ов, Магассумова сохраняет в основе не славянское прозвище, а мусульманское имя, что указывает на относительно позднюю фиксацию фамилии (не ранее XVIII–XIX веков), когда русские чиновники записывали инородцев по отчеству.

Стоит заметить, что написание с двумя «с» — не ошибка, а возможный вариант транслитерации: в татарском языке долгие согласные встречаются чаще, чем в русском, и при передаче на кириллицу их могли сохранять. Встречаются также формы Магасумова (с одной «с») — они могут быть как упрощением, так и исходным вариантом.