Фамилия Магасумов ведет начало от арабского мужского имени Магасум — диалектного варианта имени Магсум. В переводе с арабского оно означает «защищённый, чистый». Родители, нарекая так сына, желали ему спокойной и стабильной жизни, покровительства высших сил.

Словообразовательная модель здесь проста и типична для русских фамилий тюркского и арабо-мусульманского происхождения. Суффикс -ов присоединялся к основе имени, образуя притяжательное прилагательное: «чей сын?» — Магасумов. Такая модель особенно характерна для фамилий, которые фиксировались в метрических книгах и переписях населения в XIX веке, когда представители разных народов Российской империи получали фамилии по отцу.

Фамилия Магасумов распространена в регионах с компактным проживанием татар и башкир, а также встречается у народов Кавказа, где арабские имена с диалектными вариациями — обычное явление. В ономастических справочниках её нередко объединяют в одно гнездо с фамилиями Магсумов, Махсумов и Магасумов, так как все они восходят к одному корню с разной передачей звуков при записи. Интересно, что вариант с буквой «а» во втором слоге (Магасум вместо Магсум) мог закрепиться под влиянием местного произношения или просто из-за ошибки писаря, что нередко случалось при оформлении документов.