Фамилия Магдебор — редкий случай, когда основа не оставляет сомнений: перед нами немецкая географическая фамилия, образованная от названия города Магдебург (Magdeburg). В русской передаче конечное «-бург» закономерно превратилось в «-бор» под влиянием акающего произношения и привычных славянских суффиксов. Так что предок Магдебора — выходец из столицы Саксонии-Анхальт, одного из древнейших городов Центральной Германии.

Словообразовательная модель здесь проста: топоним + нулевой суффикс. Человек, носивший прозвище Магдебор, получил его по месту прежнего жительства — так в России называли переселенцев, мастеров и купцов, осевших среди русских или украинцев. В отличие от фамилий на «-бург» (Шенбург, Эренбург), которые иногда путают с дворянскими, Магдебор — фамилия однозначно простонародная, крестьянская или мещанская, и возникла она не раньше XVIII века, когда в Российскую империю хлынули немецкие колонисты.

Споров о происхождении фамилии практически нет. Версия, что основа могла быть прозвищем от диалектного «магд» (дева, служанка) с добавлением «бор» (борьба), не выдерживает критики: слишком натянута конструкция. Куда правдоподобнее, что фамилия — это искажённое «Магдебург», которое закрепилось за одним из первых носителей, записанным в ревизских сказках. В польском варианте фамилия звучала бы как Magdeburg, но в русском быту «г» оглушилось, а «бург» сократилось до «бор» — точно так же, как из Гамбурга получилась фамилия Гамбор.

География фамилии сегодня — юг России и Украина. Встречается она редко, и найти её в дореволюционных метрических книгах можно преимущественно среди колонистов Поволжья или переселенцев из Причерноморья. Носители фамилии, скорее всего, потомки тех самых немецких ремесленников и земледельцев, которых Екатерина II пригласила осваивать пустующие земли. Никакой громкой истории за фамилией не числится — зато есть чёткий след, ведущий к конкретному городу на Эльбе.