Фамилия Макарненко относится к распространенному типу украино-белорусских фамилий и образована от крестильного имени Макарий. Мужское крестильное имя Макарий в переводе с греческого означает «счастливый, блаженный». В основу же фамилии легла его производная форма – Макарень. Поэтому Макарненко буквально понималось как «сын Макарня».