Фамилия Макарушина образована от производной формы крестильного имени Макарий. В переводе с греческого это имя означает «счастливый, блаженный». За основу фамилии взяли народный вариант имени — Макаруша. Такие уменьшительно-ласкательные формы в русской традиции часто становились основой для фамилий, особенно в среде крестьян и посадских людей, где полное имя употребляли реже, а в быту пользовались обиходными вариантами.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Макарушина буквально означает «дочь (или жена) Макаруши», а в более широком смысле — «из семьи Макаруши». Эта модель типична для северных и центральных регионов России, где фамилии на -ин столь же распространены, как на юге и востоке — на -ов. По сословной принадлежности основатель рода Макарушиных, скорее всего, был человеком простого звания — крестьянином или ремесленником, поскольку у дворянских и купеческих родов чаще закреплялись полные формы имени.

Сам корень Макар- дал множество однокоренных фамилий: Макаров, Макаркин, Макарычев, Макашин. Фамилия Макарушина стоит в этом ряду особняком благодаря редкому суффиксу -уш-, который придаёт имени оттенок ласковости и бытовой непринуждённости. Если Макаров — фамилия, образованная от полного имени, то Макарушина сохранила в себе ту самую живую речь, где человека звали не по документу, а по-домашнему.