Фамилия Макеенковы — один из тех случаев, когда ответ на вопрос «откуда пошла фамилия» лежит на поверхности, но с оговоркой, которая меняет всё. Основа здесь — имя Макей, но это не простонародная форма канонического имени Матвей (как часто думают), а вариант крестильного имени Македоний. В русской традиции имя Македоний (от греческого «македонский») сократили до Макей, и от этой короткой формы пошли фамилии Макеев, Макеенко, Макеенков.

Фамилия образована по типичной для центральной России модели: суффикс -енк- указывает на «малого» или «сына», а окончание -ов закрепило принадлежность. То есть Макеенков — буквально «сын Макеенка», а Макеенок — «младший Макей». Это отчество второго порядка, характерное для северных и центральных губерний, где -енков (как и -онков) было распространённым способом образовывать фамилии у крестьян и мещан, в отличие от южнорусских -енко.

Географически фамилия Макеенковы плотно привязана к Смоленской, Брянской и соседним областям. В дореволюционных переписях и метрических книгах она встречается чаще всего в Поречском и Ельнинском уездах Смоленской губернии, что совпадает с зоной бытования фамилий на -енков (в отличие от, скажем, рязанских -енковых). Если ваши предки родом оттуда, то имя Македоний в семье могло передаваться по традиции, хотя уже к XIX веку связь с церковным именем практически стёрлась, и Макей воспринимался как самостоятельное имя.

Спорный момент: некоторые исследователи связывают Макеенкова с прозвищем Макей от глагола «макать» (мокать) — якобы так могли назвать того, кто мочит или макает что-то в работе. Но эта версия слабая: в русской ономастике прозвища от глаголов с корнем «мак-» редки, а имя Макей фиксируется в святцах (Македоний), так что церковное происхождение фамилии — основное и наиболее правдоподобное.

По сословию Макеенковы — почти всегда крестьяне. Дворянских родов с такой фамилией нет, в купеческих гильдиях она тоже не прослеживается. Это фамилия земледельцев и ремесленников из западной части России, которая не получила широкого распространения за Уралом или на юге, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска именно в Смоленщине и Брянщине.