Фамилия Махарова — женская форма фамилии Махаров, и её происхождение почти наверняка связано с тюркскими языками. Основа «махар» или «махар» встречается в ряде тюркских наречий и может означать «ловкий», «проворный», «умелый». В некоторых диалектах это слово также обозначало вид повозки или телеги. Таким образом, первый носитель фамилии Махаров мог получить прозвище за свою сноровку, быстроту в работе или, что менее вероятно, за род занятий, связанный с извозом или изготовлением телег.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русского ономастикона: суффикс -ов присоединяется к основе прозвища или имени. Мужская форма Махаров, а женская Махарова. Интересно, что фамилия эта не очень распространена и имеет ярко выраженную географическую привязку. По данным современных исследований, наибольшая концентрация носителей фамилии Махаровы наблюдается в республиках Северного Кавказа, особенно в Дагестане, а также в Астраханской области. Это косвенно подтверждает тюркские или кавказские корни, так как именно в этих регионах исторически сильны тюркские языковые влияния.

Существует и менее вероятная, но возможная версия, связывающая фамилию с арабским именем Махар (в значении «искусный», «мастер»). В этом случае фамилия могла возникнуть в среде, принявшей ислам, и передаваться через отчество. Однако версия с тюркским прозвищем выглядит предпочтительнее, так как арабское имя Махар в России встречается реже, чем тюркская лексика.

В любом случае, фамилия Махарова не относится к числу древних дворянских или боярских родов. Она сформировалась, скорее всего, в среде крестьян, казаков или городских ремесленников в XVII–XIX веках, когда прозвища и отчества окончательно закреплялись в качестве наследственных фамилий. Типичный суффикс -ов указывает на то, что фамилия образована в центральной России или на юге, а не, скажем, на Украине или в Белоруссии, где преобладали бы суффиксы -енко или -ук.