Фамилия Махаринко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках распространилась на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко (в данном случае в форме -инко, где -ин- — часть основы) изначально означал «маленький», «сын такого-то»: Махаринко — буквально «сын Махары» или «маленький Махара». Со временем он утратил уменьшительное значение и закрепился как фамильный, указывая на происхождение от человека с прозвищем.

Основа фамилии — прозвище Махара. Его происхождение неочевидно, и здесь возможны несколько версий. Самая вероятная — от украинского диалектного глагола «махарити» (мошенничать, плутовать, заниматься мелкими махинациями). В этом случае Махара — прозвище хитрого, изворотливого человека, возможно, мелкого торговца или перекупщика. В некоторых говорах «махара» могли назвать и просто растяпу, нерасторопного человека, но контекст «плутовства» встречается чаще.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими корнями: в тюркских языках есть слово «махар» (ловкий, искусный), которое могло попасть в украинские говоры через казацкую среду, имевшую тесные контакты с крымскими татарами и турками. Однако документальных подтверждений этой версии для фамилии Махаринко нет.

Фамилия географически привязана к центральным и восточным областям Украины — Черкасской, Полтавской, Киевской. В российских переписях она встречается редко, что подтверждает её украинское происхождение. В XIX веке носители фамилии были преимущественно крестьянами и казаками, реже — мещанами.

Интересная деталь: написание «Махаринко» (с «и», а не «е» в суффиксе) — это результат украинской фонетики, где безударное «е» после мягкого согласного часто переходит в «и». В официальных документах Российской империи фамилию могли записывать и как «Махаренко» — по правилам русской орфографии. Поэтому у носителей фамилии могли быть родственники с разным написанием, но с одним корнем.