Фамилия Махнюк звучит по-украински и отвечает на вопрос «чей ты?» — суффикс -ук (-юк) в украинской ономастике традиционно указывал на сына или потомка. Поэтому Махнюк — это буквально «сын Махно», «махнов наследник». Такой модели образования около пятисот лет: она массово закрепилась на землях современной Центральной и Западной Украины, особенно в Подолье, на Волыни и в Прикарпатье, где отчество с этим суффиксом постепенно превратилось в наследственную фамилию.

Само имя Махно — это не самостоятельное каноническое имя, а народная, разговорная форма, которую давали в быту. Чаще всего его связывают с именем Макар, что в переводе с греческого означает «блаженный, счастливый». Но не менее правдоподобно возводить Махно к Матвею — древнееврейскому имени со значением «дарованный богом». Оба варианта имеют право на жизнь, и выбрать один сложно: в украинских говорах усечение и смягчение начала имени было обычным делом, так что и Макар, и Матвей легко превращались в Махно. Иногда корень связывают и с именем Максим («величайший»), но эта версия встречается реже и не имеет такого прочного бытового основания, как две первые.

Если копнуть глубже, то в основе может лежать и прозвищное, а не крестильное имя. В южнорусских и украинских говорах слово «махно» или «махоня» в переносном смысле могло относиться к человеку всклокоченному, неопрятному или, наоборот, размашистому в движениях — от глагола «махать». Так что не исключено, что у части носителей фамилии предок получил прозвище за манеру поведения или внешность, а не по имени святого. Однако для фамилии Махнюк именно именная версия выглядит убедительнее: суффикс -ук прочно ассоциируется с отчествами от личных имён, а прозвища чаще давали основу для фамилий на -енко или -ов.

Интересно, что фамилия Махнюк не единственная в этом семействе. Рядом с ней живут однокоренные Махно, Махненко, Махнов, Махоня, и все они выросли из одного корня, но по-разному оформились в разных регионах. Махнюк — самая «западноукраинская» из них, тогда как Махненко тяготеет к центральным областям. Исторических документов, которые бы точно назвали первого Махнюка, не сохранилось, но логика словообразования говорит: это фамилия простого люда — казаков, крестьян или мещан, у которых отчество закрепилось без участия церковной или писарской традиции. Сейчас Махнюки встречаются и в Украине, и в России, и в диаспоре, но фамилия сохраняет узнаваемый украинский колорит.