Фамилия Махнич довольно редкая и звучит не по-русски, что сразу указывает на её происхождение. В русском языке фамилии с суффиксом -ич (как Иванович, Петрович) традиционно были отчествами, но в качестве родового имени они закрепились не у великорусов, а у белорусов и украинцев. В Беларуси и на западе Украины суффикс -ич (или -ыч) стал полноценной фамильной моделью, такой же распространённой, как -ов/-ев или -енко. Поэтому географию фамилии Махнич следует искать прежде всего в белорусском Полесье или на украинском Правобережье.

Основа фамилии — личное имя или прозвище Махно. Это уменьшительная форма от канонического имени Максим (через народные варианты Максимко → Махно) или от Матвей (Матвейко → Махно). В украинской и белорусской среде такие стяжённые формы были обычны: Махно — как Савка от Савелий, Грицько от Григорий. Соответственно, Махнич буквально означает «сын Махна» или «потомок Махна». Никакой связи с глаголом «махнуть» или со словом «мах» здесь нет — это ложная этимология, которая возникает из-за внешнего сходства.

Фамилия Махнич не имеет отношения к известному анархисту Нестору Махно, хотя однофамильцы, конечно, встречаются. Махно — это самостоятельная фамилия, а Махнич образована от той же основы, но по другой модели. Примечательно, что в белорусских метрических книгах XIX века встречаются обе формы: и Махно, и Махнич, что говорит о параллельном бытовании прозвища и отчества от него.

По сословному составу носители фамилии Махнич почти наверняка были крестьянами или мещанами. Шляхта (дворяне) в Речи Посполитой часто носила фамилии на -ич, но, как правило, с более древними корнями (например, Мицкевич, Немцевич). Простая фамилия Махнич, образованная от обиходного имени, указывает на непривилегированное происхождение. В современной России фамилия встречается рассеянно, но её очаги — Брянская, Смоленская области и Краснодарский край, куда переселенцы с Украины и Беларуси двинулись в конце XIX — начале XX века.