Фамилия Махниченко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которые исторически обозначали потомка (буквально «сын» или «маленький»). В этом ряду стоят Шевченко, Коваленко, Ткаченко, и Махниченко образовано по тому же принципу: основа + суффикс -енко.

Корень здесь — «Махно» или «Махна». Самое прямое, что приходит на ум, — это гетман Нестор Махно, но фамилия Махниченко старше и шире махновского движения. В основе лежит прозвище Махно. В украинских говорах «махнатий» значит лохматый, косматый. Скорее всего, прозвище Махно давали человеку с густыми, неопрятными волосами или бровями. Реже — с густой бородой. В некоторых диалектах «махна» могло означать и кисть руки (от «махать»), но версия с волосатостью убедительнее и встречается у ономастов чаще.

Если принять прозвище Махно как исходное, то Махниченко — его патроним: «чей сын?» — Махниченко, то есть сын Махны. Форма с -и- перед суффиксом (Махниченко, а не Махноченко) вполне обычна для украинской ономастики: так фамилия адаптировалась к более благозвучному произношению.

Географически фамилия Махниченко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Сумщине, а также к югу России (Кубань, Ростовская область), куда украинские крестьяне переселялись в XVIII–XIX веках. В дореволюционных переписях носители фамилии встречаются преимущественно среди казаков и свободных крестьян, а не среди дворянства.

Любопытная деталь: в XIX веке фамилию могли записать как Махниченко, Махначенко или даже Махновченко — вариативность в документах была обычным делом. Но именно форма с «и» закрепилась как основная. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка был выходцем из украинской среды, а его пращур — человек с заметной шевелюрой или бородой, за что и получил своё прозвище.