Фамилия Макинский — это типичная «географическая» фамилия, образованная по модели, которая указывает на связь человека с определённым местом. Суффикс -ский (в женском роде -ская) в русских фамилиях чаще всего означает «выходец оттуда-то» или «владелец того-то». Поэтому Макинский — это, скорее всего, тот, кто родом из населённого пункта с названием Макино, Мака, Маково или похожим. Такие топонимы встречаются в России и на Украине: например, село Макино в Воронежской области или хутор Макинский в Ростовской.

Основа фамилии — «Мака» или «Мак». Если отталкиваться от топонима, то название села могло произойти от прозвища или имени Мака (уменьшительное от Макар или Максим), либо от слова «мак» — в таком случае название могло указывать на местность, где сеяли мак, или на маковый цвет в гербе владельца. Есть и другая версия: фамилия могла быть искусственной, семинарской. В духовных училищах ученикам нередко давали фамилии по названиям растений, и «Макинский» мог получить юноша по прозвищу Маковский или просто из-за фамильного герба с маком.

В отличие от распространённых фамилий на -ов, Макинский встречается редко. Это говорит о том, что её носители не были массово разбросаны по стране, а скорее всего, происходят из одного конкретного рода или местности. В дворянских родословных книгах эта фамилия не фигурирует, что указывает на её происхождение из крестьянской или мещанской среды, хотя суффикс -ский в XIX веке могли использовать и как «облагораживающий» — например, при записи вольных крестьян в рекруты или при переезде в город.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Макинский — не единственная в этом ряду. Есть Маков, Маковский, Макаров, Макин. Но именно форма на -ский выделяет её как «указующую на место», а не на отчество или ремесло. Вероятнее всего, первый носитель фамилии был либо помещиком, владевшим деревней Макино, либо крестьянином, которого записали по названию родной деревни при составлении ревизских сказок.