Фамилия Маковеев — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а библейское прозвище. Она восходит к слову «Маккавей» — так называли героев из Ветхого Завета, братьев-воинов, восставших против чужеземного владычества. Само слово происходит из иврита: «маккаби» означает «молот», и это прозвище закрепилось за Иудой Маккавеем, предводителем восстания.

Фамилию образовали по стандартной модели: к основе «Макове(й)» добавили русский патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — «сын Маковея»). В церковной среде прозвище Макковей (или Маковей) давали человеку, который отличался упорством, силой духа или внешне напоминал библейского персонажа. В бытовой речи имя могло закрепиться и за крещёным евреем, и за простым крестьянином, получившим такое прозвище от односельчан.

В народном произношении сочетание «кк» упростилось до «к» — так появился вариант Маковей, а от него и фамилия Маковеев. На письме встречается и двойное «к» (Макковеев), но это более редкая форма, тяготеющая к книжному, церковному произношению. Географически фамилия чаще всего встречается в южнорусских и украинских областях, а также среди старообрядцев, где библейские имена сохранялись дольше.

Интересно, что с Маккавеями связан и церковный праздник — день памяти семи мучеников Маккавеев, который в народе совпадал с Маковеем (14 августа). В некоторых семьях фамилия могла закрепиться за ребёнком, родившимся в этот день, или за человеком, носившим имя Маковей в честь праздника. Таким образом, за фамилией стоит не просто прозвище, а целый пласт библейской и народной культуры.