Фамилия Макушкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Макушкин послужило мирское имя Макушка. Фамилия Макушкин образована от имени Макушка, просторечной формы христианских мужских имен Мокей (в переводе с греческого – «насмешник»), Максим (в переводе с латинского – «величайший»), Макар (в переводе с греческого – «блаженный, счастливый»). Менее вероятно, что фамилия Макушкин происходит от прозвища Макушка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Макушка, со временем получил фамилию Макушкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Макушкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Макушкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.