Фамилия Малафеевские — редкий пример фамилии на -ский, образованной не от географического названия, а от личного имени. Обычно суффикс -ский указывает на дворянское происхождение или принадлежность к месту, но в случае с Малафеевскими он работает иначе: это отчество второго порядка, то есть «внук Малафея» или «сын Малафеева».

В основе лежит имя Малафей — народная, разговорная форма церковного имени Малахий. В переводе с древнееврейского «Малахий» означает «посланник Божий», что делает фамилию не просто бытовым прозвищем, а наследственным именем с библейскими корнями. Такое имя в крестьянской и мещанской среде было распространено, но редко давало начало фамилии на -ский, что само по себе необычно.

Скорее всего, предок носителя фамилии был человеком из простого сословия, но в какой-то момент его потомок — возможно, при переходе из крестьян в мещане или при записи в ревизские сказки — получил фамилию по модели, характерной для шляхты и духовенства. Фамилия Малафеевские буквально означает: «Малафей → его сын (Малафеев) → его внук (Малафеевский)». То есть это трёхступенчатая родословная, свёрнутая в одну фамилию.

Географически фамилия тяготеет к западным и юго-западным регионам бывшей Российской империи — там, где польская и украинская ономастика смешивалась с русской, и фамилии на -ский были особенно часты у духовенства и однодворцев. О точном месте и времени возникновения фамилии говорить трудно: процесс формирования фамилий был длительным, а письменные источники по таким «поздним» фамилиям часто разрозненны.

Несмотря на внешнюю «дворянскую» форму, Малафеевские — это фамилия, которая закрепляет память о конкретном предке с редким библейским именем, а не о владении землёй или поместьем. Это делает её интересным памятником народной культуры и славянской письменности: в ней соединились церковная традиция, бытовая фонетика и сословная модель образования фамилий.