Фамилия Малахин — из числа тех, что образованы от полной формы крестильного имени. В её основе лежит библейское имя Малахий (др.-евр. «посланник Божий»). В православных святцах это имя носил один из двенадцати малых пророков Ветхого Завета. Модель образования проста: к основе имени Малахий прибавили типичный русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность. В буквальном смысле Малахин — «сын Малахия» или «потомок того, кого звали Малахий».

В бытовом произношении имя Малахий часто редуцировалось до кратких форм — Малах, Малаха, Малашка. Именно от этих обиходных вариантов и пошла фамилия. Если бы она образовалась от полной канонической формы, мы бы, скорее всего, имели вариант Малахиин, но язык упростил звучание. Поэтому фамилия Малахин — это не столько книжная, сколько народная, живая форма.

Интересно, что имя Малахий никогда не было частым на Руси. В святцы оно попало, но в крестьянской и купеческой среде встречалось редко. Соответственно, и фамилия Малахин — не из массовых. Она могла закрепиться в семьях, где мальчика назвали в честь святого, или в старообрядческой среде, где ветхозаветные имена ценили выше новозаветных.

Фамилия на -ин типична для северных и центральных областей России, а также Поволжья. Встречается она в основном в форме Малахин, хотя возможны и варианты Малахов, Малашкин — от тех же корней, но с другими суффиксами. Малахин — это не про географию, а про конкретный способ словообразования: фамилия хранит память о том, как в конкретной семье звучало имя предка.