Фамилия Мальская — женская форма фамилии Мальский, и её происхождение неоднозначно. Самая прямая версия: в основе лежит прозвище или нецерковное имя Маль, образованное от прилагательного «малый». Такое имя могло указывать на невысокий рост предка или на его младший возраст в семье. В старину имена от корня «мал-» были очень распространены: Малец, Малюта, Малыш, Малява. К этому же ряду относится и имя Маль. Взрослея, человек мог сохранить это именование, которое со временем закрепилось как фамильная основа.

Менее вероятна версия, связывающая фамилию с татарским словом «малик» — «след, следы по снегу или песку». Если принять эту гипотезу, можно предположить, что предок Мальских был охотником, выслеживающим зверя. Однако эта версия спорная, так как фамилия имеет явно славянский суффикс -ск-, указывающий на принадлежность к местности или роду.

Гораздо интереснее географическая привязка. Фамилия Мальская могла произойти от названия Мальского озера в Псковской области, у деревни Малы. На его берегу в глубокой лощине находится бывший Мальский Спасо-Рождественский монастырь (Онуфриева пустынь), названный по имени основателя, проповедника Онуфрия Мальского. В этом случае предок носительницы фамилии мог родиться или жить на берегу этого водоема, а фамилия указывает на его происхождение из тех мест. Таким образом, потомок человека по прозвищу Маль или выходец с берегов Мальского озера со временем получил фамилию Мальский, от которой образована и Мальская.