Фамилия Малухин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Малухин послужило мирское имя Малуха. Фамилия Малухин, скорее всего, образована от распространённого в старину мирского имени с основой «мал-» - «маленький». В семьях маленького ребенка часто называли просто Мальцом, Малютой, Малышом, Малухой. И даже когда ребёнок становился взрослым, он по-прежнему носил детское имя Малуха, которое впоследствии закрепилось в фамилии. Согласно другой гипотезе, фамилия Малухин восходит к прозвищу Малуха, которое указывало на особенности внешности человека, а именно — невысокий рост. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Малуха, со временем получил фамилию Малухин. О точном месте и времени возникновения фамилии Малухин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Малухин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.