Фамилия Манухин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Манухин послужило имя Мануха. Фамилия Манухин образована от распространенного в старину мужского имени Иммануил (в переводе с древнееврейского – “с нами Бог”). Это имя имело ряд производных форм, одна из которых – Мануха – и легла в основу данной фамилии. Покровителем имени Мануил (Иммануил) считался святой мученик Мануил, который вместе с Феодосием пострадали за веру во Христа в 304 году в Сирмии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мануха, со временем получил фамилию Манухин. О точном месте и времени возникновения фамилии Манухин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Манухин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.