Фамилия Марлухин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы добраться до сути, нужно отбросить очевидное и присмотреться к словообразовательной модели и возможным диалектным корням.

Сразу бросается в глаза суффикс -ухин. В русских фамилиях он встречается нечасто и обычно указывает на прозвище, образованное с помощью экспрессивного суффикса -ух(а) (как Вертуха, Грязнуха). Фамилия на -ин говорит о принадлежности: «сын Марлухи» или «человек из рода Марлухи». Основа здесь — Марл-, что не похоже на распространённое крестильное имя (в святцах нет ни Марла, ни Марлаха). Значит, ищем прозвище или местное слово.

Наиболее правдоподобная версия отсылает к диалектному глаголу «марлы́кать» или «марлы́чить». В некоторых южнорусских и украинских говорах так говорят о невнятной, бормочущей речи, о человеке, который говорит «себе под нос» или мямлит. Прозвище Марлуха мог получить либо неразборчивый в речи человек, либо, наоборот, тот, кто постоянно что-то ворчливо бормотал. Суффикс -ух- в этом случае усиливает пренебрежительный или шутливый оттенок.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — связь с тюркским корнем. В казахском и татарском языках есть слово «марлы» (марлы) — «богатый», «обильный». Прозвище Марлы могли дать зажиточному крестьянину, а на русской почве оно обрастало суффиксами: Марлы → Марлуха → Марлухин. Однако для фамилии, оканчивающейся на -ин, такая основа нетипична (обычно тюркские основы дают фамилии на -ов), поэтому эта версия слабее.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Поволжью. В дореволюционных метрических книгах Марлухины встречаются в Саратовской, Тамбовской и Воронежской губерниях — как раз в зоне, где диалектные слова с корнем «марл-» фиксируются этнографами. Сословно это были, скорее всего, государственные крестьяне или однодворцы, то есть лично свободные землепашцы, а не крепостные.

Сравните с однокоренными, но более редкими фамилиями: Марлычев, Марлыкин, Марлушкин. Все они образованы по одной модели — от прозвища с корнем «марл-», что подтверждает его диалектную, а не имени-календарную природу.

Таким образом, предок носителя фамилии Марлухин, вероятнее всего, получил прозвище за манеру речи — невнятную, бормочущую или ворчливую. Прямого значения «красивый» или «богатый» в русской основе нет, но есть живая, немного ироничная характеристика человека из крестьянской среды.