Фамилия Манешев образована от имени или прозвища Манеш. Самая вероятная основа — тюркское мужское имя Манеш, которое в ряде языков (казахском, татарском, башкирском) восходит к арабскому «мани» — «смысл», «значение», либо к «ман» — «я», в составе сложных имён. Встречается и вариант, где Манеш — уменьшительная форма от имени Мансур (от арабского «мансур» — «победоносный»). Оба корня дают одну модель: основа + суффикс -ев, указывающий на принадлежность: «сын Манеша».

Суффикс -ев (а не -ов) подсказывает, что исходное имя или прозвище оканчивалось на мягкий согласный или «ш». В русской антропонимике фамилии на -ев обычно возникали в среде, где основу произносили с мягким окончанием: Манеш, а не Манешъ. Это характерно для южнорусских и восточных регионов, где фамилии тюркского происхождения часто адаптировались через -ев. Географически Манешевы встречаются в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — зонах активных контактов русского и тюркского населения.

Есть и менее вероятная версия: от прозвища Манеш, связанного с глаголом «манить» или «манить» в диалектном значении «звать», «привлекать». Тогда прозвище мог получить человек заманчивый, обходительный или, наоборот, тот, кто заманивал в ловушку. Но эта гипотеза слабее: тюркское происхождение подкрепляется и типичной для таких фамилий огласовкой, и ареалом бытования.

Сословная принадлежность предков Манешевых не определяется однозначно. Как и многие фамилии на -ев из тюркских основ, она могла принадлежать как крестьянам, так и служилым людям — казакам, толмачам, детям боярским. В документах XVIII–XIX веков Манешевы фиксируются среди государственных крестьян и однодворцев южных губерний. Фамилия редкая, не входит в списки старомосковского дворянства, но её носители оставили след в истории отдельных сёл и станиц.