Фамилия Мангушова — редкий случай, когда географическое название почти наверняка перешло в фамилию напрямую, без промежуточного прозвища. Основа здесь — топоним Мангуш. Так называется несколько населённых пунктов: самый известный — посёлок городского типа в Донецкой области (ныне город Мангуш), а также село в Крыму и хутор в Волгоградской области. Фамилию могли получить выходцы из этих мест, причём, скорее всего, не крестьяне, а казаки или мещане, которые при переписи указывали место выхода как родовое имя.

Суффикс -ов- указывает на стандартную русскую модель «чей?» — сын Мангуша. Но сам топоним Мангуш имеет тюркские корни. Наиболее вероятная версия: от тюркского «манкуш» или «манкыш» — «глухой, не имеющий слуха» или, в переносном смысле, «упрямый, несговорчивый». В тюркской ономастике такое прозвище могло закрепиться за основателем поселения. Менее популярная, но допустимая гипотеза — связь с этнонимом «мангуты» (одно из монгольских племён), однако для славянской фамилии это слишком опосредованная цепочка.

В дореволюционных источниках фамилия встречается нечасто. Поскольку Мангуш в Приазовье был крупным греческим селом, нельзя исключать, что часть носителей фамилии — потомки греков, переселившихся из Крыма в конце XVIII века и получивших фамилию по новому месту жительства. Греческие фамилии на -ов тогда не были редкостью — их записывали по русским стандартам.

С ударением возможны два варианта: Мангýшова (от топонима Мангýш) и Мáнгушова (от фамилии Мáнгуш). Второй вариант характерен для говоров, где ударение в фамилиях на -ов смещается на корень.

Таким образом, Мангушова — фамилия-маркер: она почти не оставляет сомнений, что предки жили в одном из поселений с этим тюркским названием, скорее всего, в Приазовье или Крыму.