Фамилия Манидина — нечастая, и её происхождение напрямую связано с историей русских прозвищ. Это женская форма, а мужская — Манидин. В основе фамилии лежит прозвище Манида, которое в русских говорах имело вполне конкретный смысл. Слово «манида» означало «обманщик», «плут», того, кто манит, завлекает обещаниями, но не выполняет их. Так могли прозвать человека нечестного, склонного к хитростям или, наоборот, того, кто любил подшутить и ввести в заблуждение ради смеха.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Манидин, то есть сын или потомок Маниды. Такая модель образования типична для русских фамилий, возникших из прозвищ, оканчивающихся на -а. По этой же схеме сложились фамилии Бородин (от Борода), Головин, Молчанов. Географически фамилия Манидина, скорее всего, имеет корни в северных или центральных областях России — в тех говорах, где слово «манида» было в ходу. Встречается она и сейчас, но преимущественно в небольших количествах, что говорит о её локальном происхождении.

Интересно, что однокоренные фамилии — Манин, Маничев, Манихин — имеют разные суффиксы, но общий корень «ман-», связанный с глаголом «манить». Однако Манидина стоит особняком: если Манин мог произойти от имени Маня (уменьшительное от Мария) или от прозвища Маня, то Манидина надёжнее привязывается именно к прозвищу Манида. Спорных версий здесь немного, и самая правдоподобная — именно та, что отталкивается от прямого значения слова.

В сословном отношении носители фамилии могли быть крестьянами или посадскими людьми. Фамилии на -ин в этой среде были обычны, а прозвище Манида вряд ли дали бы представителю духовенства или дворянства. Поэтому предки Манидиных, скорее всего, были людьми незнатными, но с характером — острым на язык или себе на уме.