Скорее всего, фамилия Манишева образована от тюркского мужского имени Маниш, которое является вариантом имени Манас. В переводе на русский язык оно означает «бесстрашный богатырь». Менее вероятно, что фамилия Манишева образована от имени Маня. В переводе с древнееврейского оно означает «любимая, желанная», «госпожа». В то же время, существует довольно большое количество польских и белорусских фамилий, начинающихся на Ман-: Манич, Маневич, Маневский, Манкевич. Все они образованы от различных форм имении Иммануил (Мануил). Это имя в переводе с древнееврейского означает «с нами Бог». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Манишевых можно лишь на основании генеалогических исследований.