Фамилия Манишин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Манишин послужило церковное имя Мануил. Имя Маниша представляет собой производную форму имени Мануил (Иммануил), которое в переводе с древнееврейского означает «с нами Бог». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Маниша, со временем получил фамилию Манишин. О точном месте и времени возникновения фамилии Манишин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Манишин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.