Имя Маниша представляет собой производную форму имени Мануил (Иммануил), которое в переводе с древнееврейского означает «с нами Бог». Скорее всего, основатель рода Манишиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Маниша, со временем получил фамилию Манишин.