Фамилия Манникова — женская форма от Манников, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Манник. В русских говорах слово «манник» имело два основных значения, и оба могли лечь в основу фамилии.

Первое и самое вероятное — манником называли человека, который любил или умел готовить манную кашу, либо того, кто её продавал. Манная крупа в XIX веке была продуктом не повседневным, а скорее праздничным или дорогим, поэтому прозвище могло закрепиться за торговцем на базаре или за поваром в зажиточном доме. Второе значение — диалектное: в некоторых областях «манником» звали обманщика, льстеца, того, кто «манит» обещаниями. Оба корня — от глагола «манить» (звать, привлекать, обольщать).

Словообразовательная модель проста и типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть Манников — сын или потомок Манника. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская по происхождению, что подтверждается её распространением: Манниковы чаще всего встречаются в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской и Рязанской областях, где манная каша была традиционным блюдом.

Стоит отметить, что фамилия Манников — редкая, её нет в списках массовых русских фамилий. Это делает её ценной для генеалогического поиска: скорее всего, все носители фамилии происходят из одного или двух родов, а не из множества разрозненных линий. Если ваши предки — Манниковы, ищите их в крестьянских ревизских сказках XIX века, особенно в документах Воронежской губернии.