Фамилия Манолидис — это фамилия-патроним, указывающая на происхождение от личного имени. Она образована по греческой модели, где к основе мужского имени добавляется суффикс -идис, который означает «сын» или «потомок». Таким образом, Манолидис буквально переводится как «сын Манолиса».

Основа фамилии — греческое имя Манолис. Это народная, сокращённая форма полного имени Эммануил, которое восходит к древнееврейскому Иммануэль — «с нами Бог». В греческой ономастике имя Манолис было одним из самых распространённых, что объясняет и частоту фамилий на -идис, образованных от него.

Суффикс -идис — один из ключевых маркеров греческих фамилий. Он аналогичен русскому -ов/-ев или грузинскому -дзе. Встречается он преимущественно в регионах, где греческое население жило компактно веками: на территории современной Греции, в Малой Азии (до обмена населением 1923 года), а также в греческих диаспорах Причерноморья — в Крыму, Одессе и Мариуполе. Носители фамилии Манолидис, оказавшиеся в России, — это, скорее всего, потомки греческих переселенцев времён Екатерины II, когда греков приглашали осваивать южные земли, или более поздних беженцев из Османской империи.

В отличие от многих славянских фамилий, у Манолидис нет сословной окраски: её мог носить и крестьянин, и городской ремесленник, и священник. Фамилия не меняла окончания при склонении в русском языке — она остаётся неизменяемой, что типично для греческих заимствований. Единственная вариация, которая встречается в документах, — написание с одним «с» (Манолидис вместо Маннолидис), но это скорее ошибка переписчика, чем отдельная ветвь рода.