Фамилия Манус — редкий пример, когда мы имеем дело не с русской патронимической моделью, а с прямым заимствованием. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ин или -ский, Манус не имеет суффикса принадлежности. Это либо транслитерация иноязычной фамилии, либо застывшее прозвище, которое не стали русифицировать.

Самая вероятная версия — латинское происхождение. «Manus» с латыни переводится как «рука». В средневековой Европе это слово могло стать прозвищем человека с сильными руками, мастера, работающего руками, или, по аналогии с немецкой фамилией Ганд (Hand), просто «правой руки» какого-либо господина. В католических землях (Польша, Литва, Беларусь) латынь была языком делопроизводства и образования, поэтому фамилия могла возникнуть в шляхетской или мещанской среде.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — это связь с библейским именем Манассия (Менаше). В сокращённой форме «Манус» или «Манас» такое имя бытовало у евреев-ашкеназов. В этом случае фамилия образована по той же модели, что и Абрам — Абрамус, то есть с латинизированным окончанием. В Российской империи носители такой фамилии могли оказаться выходцами из Царства Польского или черты оседлости.

Поскольку фамилия встречается и в современной России, и в Прибалтике, и в Германии, важно смотреть на историю семьи. Если предки были православными крестьянами — скорее всего, фамилию дал священник в семинарии (искусственная фамилия от латинского слова) или это искажённое «Мануйлов» (от имени Мануил). Если род происходит из западных губерний — версия с польской шляхтой или еврейским именем становится основной.