Фамилия Манышевы, судя по всему, происходит от прозвища или имени Маныш. В основе лежит тюркское слово «маныш», которое означает «быстрый», «торопливый» или «проворный». Такое прозвище могли дать человеку с живым, стремительным характером. Это самая прямая и очевидная версия.

Однако есть и вторая, географическая. В Пермском крае существует деревня Маныш, а в Туркмении — село Маныш. Родоначальник фамилии мог получить фамилию по названию местности, где жил или откуда был родом. В этом случае фамилия Манышев — не прозвищная, а топонимическая.

Фамилия образована по стандартной русской модели с помощью патронимического суффикса -ев (после шипящего и мягкого знака). То есть Манышевы — это буквально «дети Маныша». Суффикс указывает на то, что фамилия сформировалась в русской языковой среде, даже если её основа — иноязычная.

В истории русских фамилий много примеров, когда тюркские корни уходили в среду служилых людей и дворянства. В XV–XVII веках выходцы из Золотой Орды, от печенегов или половцев нередко поступали на русскую службу, крестились и получали фамилии, образованные от их прежних имён или прозвищ. Манышевы могли быть именно такой семьёй — родоначальник пришёл с востока, а его потомки уже стали русскими помещиками или служилыми людьми.

Словообразовательная модель здесь простая, но не самая частая. Основа Маныш- с суффиксом -ев встречается реже, чем, скажем, Манышевский или Манышин. Это говорит о том, что фамилия закрепилась в конкретном роду, а не разошлась по разным ветвям с разными суффиксами.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, например, Манышевский или Манышин, то Манышевы — более старая и прямая форма, без дополнительных суффиксов принадлежности или знатности. Это указывает на то, что фамилия могла возникнуть в среде крестьян или однодворцев, а не только среди дворян. В любом случае, точных данных о сословной принадлежности всех Манышевых нет, и строить здесь однозначные выводы рискованно.