Фамилия Манзурина образована по самой распространённой в русском языке модели — с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей сын?» — «Манзурин». Основа здесь — мужское личное имя или прозвище Манзура. Само слово «манзура» в русских говорах — нечастое, но с устойчивым значением. В словарях диалектной лексики манзурой называли медлительного, нерасторопного человека, иногда — вялого или ленивого. Вероятно, прозвище давали тому, кто делал всё медленно, «тянул резину», или, наоборот, отличался спокойным, флегматичным нравом.

Есть и другая, менее очевидная версия. В некоторых регионах манзурой могли называть человека, занимавшегося мелкой торговлей или менялой — от тюркского «манзур» (образец, мера). Однако эта гипотеза слабее, так как в русской ономастике фамилии на тюркской основе чаще образуются через суффикс -ов, а не -ин. Модель с -ин типична для прозвищ и имён с окончанием на -а, -я, и Манзура здесь — чисто русское диалектное слово.

Географически фамилия Манзурина привязана к северным и центральным губерниям России. В переписных книгах XVII–XVIII веков носители фамилии встречаются в Вятской, Пермской и Костромской землях — регионах, где диалектная лексика сохраняла архаичные слова. Крестьяне и посадские люди с таким прозвищем могли жить в тех же местах, где бытовало и слово «манзурить» — означавшее «мешкать, копаться». Фамилия не дворянская и не купеческая, а народная, низовая, что подтверждается её прозвищным происхождением.

С точки зрения словообразования, фамилия Манзурина — это типичный пример перехода прозвища в фамилию без промежуточных форм. От неё образованы однокоренные фамилии: Манзуров (с другим суффиксом, более южный вариант) и Манзуркин (с уменьшительным суффиксом). Встречается также написание через «о» — Монзурин, что связано с аканьем в говорах, но это редкий вариант.