Фамилия Маргория — редкий случай в русском ономастиконе. На первый взгляд она кажется иноязычной, напоминая французское Marguerite (маргаритка) или имя Маргарита, но на деле её происхождение, скорее всего, иное и куда более прозаичное. Ключ к разгадке — не в корне «марго», а в суффиксе.

В русских фамилиях суффикс -ия нетипичен. Он встречается в книжных, церковных или искусственных фамилиях, образованных от латинских или греческих основ (например, фамилии семинаристов вроде Сперанский — от лат. spero «надеюсь»). Однако для крестьянских или мещанских родов такая модель почти не характерна. Гораздо вероятнее, что Маргория — это видоизменённая форма фамилии Маргорин или Маргорев, где суффикс -ин/-ев со временем утратился или был переосмыслен под влиянием женского имени Марго.

Основа «Маргор» восходит к просторечной форме имени Маргарий (церковное, от греч. μαργαρίτης — «жемчужина»). В русских говорах имя Маргарий давали редко, но оно фиксируется в святцах. От него образовывали отчества: сын Маргария — Маргарич, а в народе — Маргорин сын, то есть Маргорин. Фамилия Маргория могла возникнуть, когда писарь или сам носитель записал отчество в «окающем» варианте (Маргорий вместо Маргарий) или переделал окончание на -ия, придав фамилии более «благородное» звучание.

Есть и вторая, менее вероятная версия: фамилия могла быть образована от прозвища Маргора — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли человека с резким, «марким» голосом или, напротив, того, кто «горит» (спешит, суетится) на работе. Но эта гипотеза слабая, так как прозвища с таким корнем редки, а суффикс -ия для них нехарактерен.

Географически фамилия Маргория встречается единично, преимущественно в центральных областях России. Сословно её носители, скорее всего, выходцы из духовенства или мещанства, где книжные имена и искусственные фамилийные формы были в ходу. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит поискать в метрических книгах вариант Маргорин — он мог быть исходным, а Маргория — более поздней, «улучшенной» записью.