В данном случае в основу фамилии Марьин легло распространенное на Руси имя Мария. Оно пришло к нам из древнееврейского mrym – Мариам, что в переводе означает «любимая, желанная, госпожа». В результате, потомок женщины, обладающей именем Марья, со временем получил фамилию Марьин.