Фамилия Мархандаева — редкая и неочевидная с точки зрения внутренней формы. Чтобы понять её происхождение, нужно смотреть не на готовую фамилию, а на то, как она могла возникнуть в живой речи.

Основа фамилии — Мархандай. Это не славянское имя, а скорее всего тюркское или монгольское личное имя. В нём легко угадывается корень «мархан» — это искажённое «мурза» или «мирза» (от персидского «эмир-заде» — «княжич», «сын князя»). В тюркской среде «мурзой» называли знатного человека, главу рода. Вторая часть — «дай» — распространённый в тюркских и монгольских именах аффикс (ср. Кудай, Таймас, Алдай), который часто не переводится отдельно, а служит для оформления имени.

Таким образом, Мархандай — это составное имя, означавшее «мурза-князь» или «господин». Его могли дать ребёнку в знатных семьях или, наоборот, как прозвище-пожелание простолюдину. В пользу тюркского происхождения говорит и конечный суффикс фамилии: -аев (вместо более привычного -ев). Это типичный вариант русификации тюркских фамилий, особенно в среде казанских татар, башкир или народов Кавказа. Фамилии на -аев часто записывали у крещёных татар и мишарей.

Самый редкий элемент — ударение. В фамилии Мархандаева оно, скорее всего, падает на третий слог: Марханда́ева. Это подтверждает, что основа — не славянское слово, а заимствованное имя, которое не подчиняется стандартной модели ударения русских фамилий на -ов/-ев.

Если говорить о возможных предках, то носитель фамилии мог происходить из служилых татар или из башкирских родов, которые после принятия православия получали фамилии по имени отца. Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Уралу — регионам, где смешивались русские, тюркские и финно-угорские традиции имянаречения. Встречается она и среди осетин, но в осетинском языке имя Мархандай могло быть переосмыслено как «убивающий врага» (от «мар» — убивать, «ханд» — враг), хотя эта версия менее вероятна из-за отсутствия типично осетинского суффикса.

По сословной принадлежности сказать что-то определённо трудно: среди Мархандаевых могли быть и крестьяне, и купцы, и духовенство. Единственное, что можно утверждать с высокой вероятностью, — фамилия не дворянская и не княжеская, а народная, образованная от личного имени, которое когда-то было прозвищем или именем-оберегом.