Фамилия Марковаф — редкий пример того, как нестандартное написание может скрывать за собой вполне стандартную основу. Скорее всего, перед нами вариант фамилии Марков, где конечная буква «в» заменена на «ф». Такое написание — не ошибка, а следствие исторической особенности: в ряде русских диалектов, а также под влиянием украинского или белорусского языков глухой звук «ф» на конце слова мог заменять звонкий «в» (оглушение). Аналогичные примеры: Иваноф, Петроф, Смирноф — в дореволюционных документах и вывесках такое встречалось повсеместно, особенно у купечества и мещан, которые писали фамилию на слух.

Основа фамилии — каноническое имя Марк (от латинского Marcus, предположительно «молот»). Фамилия Марков (и её фонетический вариант Марковаф) образована по простейшей патронимической модели: от имени отца Марк через притяжательный суффикс -ов. То есть Марковаф буквально означает «сын Марка». Это типичная «фамилия-отчество», каких в России большинство.

Версия, что Марковаф может быть искусственной или иноязычной (например, тюркской или еврейской), маловероятна. Фонетика фамилии чисто славянская, а корень Марк — общехристианский. Встречаемость фамилии крайне низкая, что подтверждает её локальный характер: скорее всего, она закрепилась в одной семье или в одном регионе, где оглушение конечного «в» было нормой.

С точки зрения социального контекста, носители фамилии Марковаф, как и большинство Марковых, могли быть крестьянами, мещанами или духовенством (имя Марк чтится в православии). Если фамилия зафиксирована в старых метрических книгах, вероятно, предки жили в южных или западных губерниях Российской империи, где подобное написание было распространено.

Таким образом, Марковаф — не самостоятельная редкая фамилия, а орфографический дубль фамилии Марков, сохранившийся из-за диалектного произношения или канцелярской записи «на слух». Её главная ценность для потомков — как раз в этом необычном написании, которое может помочь отличить свою ветвь от многочисленных однофамильцев с окончанием на -ов.