Фамилия Марковский образована от крестильного имени Марк, которое пришло на Русь с христианством. В основе имени лежит римское родовое имя Marcus, а его значение до сих пор вызывает споры: по одной версии, оно переводится как «слабый» или «вялый», по другой — как «родившийся в марте» (по названию месяца, посвящённого богу Марсу). В любом случае, имя было популярным, и от него возникло множество фамилий.

В отличие от простых русских фамилий на -ов/-ев, суффикс -ский в фамилии Марковский указывает на иной путь происхождения. Чаще всего такие фамилии носили дворяне, шляхта или выходцы из духовного сословия. В польской, украинской и белорусской традиции фамилии на -ский были признаком принадлежности к благородному роду или владения землёй (например, поместьем, названным по имени владельца). Поэтому Марковский мог означать не просто «сын Марка», а «происходящий из рода Марка» или «владелец Маркова».

Однако в России фамилия Марковский встречается и среди крестьян, особенно после того, как в XIX веке священники массово давали семинаристам фамилии по именам святых с суффиксом -ский. Таким образом, предок мог быть как мелкопоместным шляхтичем, так и сыном дьячка, получившим звучную фамилию при поступлении в семинарию. Однозначно сказать, какой именно вариант верен для конкретной семьи, можно только по результатам генеалогического исследования — письменные источники часто различаются в зависимости от региона и сословия.