Фамилия Маркватов — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. В её основе лежит имя или прозвище, но вот какое именно — вопрос открытый. Самая прямая и логичная версия: от крестильного имени Марк (от латинского Marcus — «молоток» или посвящённый богу Марсу). Однако фамилия образована не от самого имени, а от его производной формы — Марква́т. Суффикс -ат в данном случае — не типичный русский, а скорее западный или южнославянский элемент, указывающий на носителя признака: «Маркват» — тот, кто связан с Марком, возможно, сын или слуга человека по имени Марк. Фамилия же на -ов — классическая русская патронимическая модель, означающая «принадлежащий Марквату», то есть потомок этого человека.

Вторая версия, менее популярная, но имеющая право на существование: фамилия могла возникнуть от прозвища, связанного с диалектным словом. В некоторых говорах «марква» — это морковь (от литовского morka или польского marchew). В таком случае «Маркват» — человек, имеющий отношение к моркови: либо огородник, либо торговец, либо человек с рыжеватыми волосами. Суффикс -ат здесь работает по той же модели, что и в фамилиях Бородат, Горбат — указывает на яркий внешний или профессиональный признак. Эта версия объясняет необычное для русского уха сочетание звуков, но уступает первой по вероятности: прозвища от названий овощей встречаются, но редко становятся основой для фамилии с таким суффиксом.

География фамилии тоже подсказывает её происхождение. Маркватовы встречаются в основном в Поволжье и на юге России — в Волгоградской, Ростовской областях, а также в Краснодарском крае. Это регионы, где исторически смешивались русские, украинские и тюркские влияния. Интересно, что фамилия могла возникнуть и на стыке культур: скажем, у крещёных калмыков или татар, где имя Марк переделывали на местный лад, добавляя тюркский аффикс -ат (в значении «обладающий»). Получался гибрид «Маркват» — «обладающий Марком», то есть названный в честь Марка. Затем русский суффикс -ов окончательно оформил фамилию.

С точки зрения словообразования, Маркватов стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Минаватов, Савватов, Селиватов. Все они образованы от неканонических народных форм крестильных имён (Мина, Савва, Селиван) с добавлением суффикса -ат- и последующего -ов. Это указывает на то, что фамилия — не случайное искажение, а результат живой народной традиции переделывать имена на свой лад. Предки Маркватовых, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по отцу или деду, которого в быту звали не просто Марк, а именно Маркват — так, как это было принято в конкретной местности.