Фамилия Марнаузов — один из тех редких случаев, когда географическая привязка перевешивает все остальные версии. Её основа — топоним Марнауз (или Марнаут). Так называется село в Ингушетии, расположенное в Джейрахском районе. Выходца из этого села в русском делопроизводстве XIX века и записывали как Марнаузов — по модели «название места + суффикс -ов», означающей принадлежность. Суффикс -ов здесь типично русский, адаптировавший местное название под паспортную норму Российской империи. Таким образом, первый носитель фамилии — это человек, чьей малой родиной было село Марнауз.

Менее вероятная, но возможная версия отталкивается от тюркского имени или прозвища. В тюркских языках есть корень «марна» (или «марны»), который может означать «жадный», «скупой», либо быть вариантом арабского имени Марван (в честь халифа Марвана I). Однако в этом случае ожидалась бы форма Марнаев или Марнанов, а не Марнаузов. Суффикс -узов для тюркских фамилий нетипичен, он скорее указывает на окончание исходного слова на -уз/-ус. Поэтому версия с селом Марнауз выглядит не просто правдоподобнее, а единственной, объясняющей всю конструкцию фамилии целиком.

Фамилия Марнаузов — яркий пример того, как русская фамильная модель на -ов наложилась на кавказский топоним. Такие случаи массово возникали в XIX веке, когда горцев записывали по месту жительства. Носители фамилии — потомки ингушей из горного села, чья фамилия буквально переводится как «из Марнауза». Других версий, подкреплённых ономастикой, у этой фамилии нет.