Фамилия Марсаутова — редкий пример того, как в русской фамильной модели могло закрепиться имя, восходящее к древнесемитским и арабским корням. Скорее всего, в основе лежит личное именование Марсаут (или его вариант Марсауд). Оно составное: первая часть происходит от древнесемитского «мара» — «телёнок, детёныш», что в ряде культур служило ласковым обращением к ребёнку. Вторая часть — арабское имя Сауд, означающее «счастливый». Вместе именование Марсаут можно перевести как «счастливое дитя». Такое имя могли дать долгожданному или позднему ребенку, желая ему удачи.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Марсаут добавили патронимический суффикс -ов, который отвечает на вопрос «чей?» и указывает на принадлежность потомку человека с таким прозвищем или именем. Женская форма Марсаутова — естественное грамматическое окончание для носительницы фамилии.

География бытования фамилии узкая. Встречается она преимущественно на Северном Кавказе и в регионах с заметным тюркским или кавказским населением. Это косвенно подтверждает версию о восточных корнях исходного имени: через арабский язык оно могло попасть в местные ономастиконы, а затем — в русскую фамилию через метрические записи.

Другие возможные, но менее вероятные объяснения связывают фамилию с искажённым тюркским именем или прозвищем, однако арабская этимология выглядит стройнее и подкрепляется значением обеих частей. В любом случае, фамилия Марсаутова — не случайный набор звуков, а след культурного и языкового контакта, где восточное имя получило русское оформление и сохранилось в семейной истории.