Фамилия Марухненко — одна из тех, где за привычным суффиксом скрывается сразу несколько возможных историй, и выбрать единственную непросто. Начнём с самого очевидного: перед нами типичная украинская фамилия, образованная с помощью патронимического суффикса -енко. В украинской ономастике этот суффикс указывал на потомка, сына или человека, связанного с тем, кто назван в основе. То есть Марухненко — буквально «сын Марухи» или «человек из рода Марухи».

А вот что такое «Маруха» — вопрос открытый. Самая распространённая версия отталкивается от женского крестильного имени Мария. В древнееврейском оно означает «любимая, желанная, госпожа». В просторечии имя Мария давало множество уменьшительных форм, и Маруха — одна из них. В этом случае фамилия могла достаться ребёнку, которого воспитывала мать по имени Маруха, или же внебрачному сыну, которого записывали по материнскому имени. Такая практика в украинских сёлах XIX века встречалась.

Вторая версия — прозвищная. От глагола «марать» (пачкать, грязнить) легко образовалось бы прозвище Маруха для неаккуратного, неряшливого человека. Но здесь есть любопытный поворот. В языке офеней (странствующих торговцев, коробейников) словом «марушка» называли гривну, то есть денежную единицу. Если прозвище Маруха дали такому торговцу, оно могло означать не грязь, а, наоборот, бережливость или богатство — «копеечник», «денежный мешок». Эта деталь выделяет фамилию из ряда простых «марательных» прозвищ.

Третья, самая редкая и спорная версия, связывает фамилию с топонимом. На Северном Кавказе, в Кубанской области, протекает горная река Марух. Её название, по одной из гипотез, восходит к абхазскому «Ма(ршьан)рыху» — «гора Маршанов» (по имени феодального рода). Другое объяснение — искажённое «Нарых» («гора нартов»), где нарт — божество гор, неба и высоких деревьев. Возможно, на реке находилось древнее святилище. Однако маловероятно, чтобы фамилия Марухненко возникла напрямую от этого гидронима: слишком далека Украина от кавказских гор. Скорее, если предки и переселялись оттуда, то фамилия уже была при них, а не образована на месте.

Из всех трёх версий самой правдоподобной выглядит первая — от имени Мария через форму Маруха. Она объясняет и типичный украинский суффикс, и широкую распространённость фамилии в центральных и восточных областях Украины. Прозвищная версия возможна, но менее надёжна из-за редкого значения офенского слова. Топонимическая — скорее экзотика, чем реальная история большинства носителей.