Фамилия Масенис — один из тех случаев, когда сразу понятно, что корни ведут не в центральную Россию, а в балтийский или польско-литовский регион. Её выдает суффикс -ис: это классический для литовских и латышских фамилий показатель мужского рода. В русской среде такие окончания обычно усекались или русифицировались, но Масенис сохранила исходную форму — значит, предки довольно поздно попали в русскоязычный документооборот, скорее всего, из числа крестьян или мещан западных губерний.

Основа фамилии — Масен(а). Это может быть производное от имени Масей, народной формы канонического Матфей (через польское Maciej) или, реже, Матвей. В таком случае Масенис — это «сын Масеня», то есть потомок человека по имени Масей. Вторая версия, более прозаичная, отсылает к ремеслу или занятию: литовское masė (масса, множество) или masinis (массовый) здесь вряд ли при чем, а вот диалектное польское masełko (маслице) или белорусское масёнка (маленькая маслёнка) могли дать прозвище маслобою или торговцу маслом.

Географически фамилия тяготеет к Литве, особенно к Жемайтии и Аукштайтии, а также к бывшим территориям Речи Посполитой — современной Беларуси и восточной Польше. В дореволюционных метрических книгах Масенисы встречаются среди крестьян и мелкой шляхты Виленской и Ковенской губерний. Встречаемость в России невелика, и это дополнительный маркер: если вы носите эту фамилию, скорее всего, ваши предки переселились вглубь страны в конце XIX — начале XX века, в ходе столыпинской аграрной реформы или Первой мировой войны.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия прозрачна: корень Масен- плюс патронимический суффикс -ис. Это не русская «сыновья» конструкция на -ов/-ев и не польская на -ский, а именно балтийский способ указания на родство. Поэтому однокоренные русские фамилии вроде Масенков или Масенов к ней прямого отношения не имеют — они могли возникнуть независимо от другого прозвища или имени.