Фамилия Машаруев — редкая и неоднозначная по происхождению, что делает её разбор особенно интересным. В отличие от большинства русских фамилий, оканчивающихся на -ов/-ев, её основа неочевидна, и здесь возможны два основных пути.

Первый и самый вероятный — связь с именем Машар. Это может быть диалектная или фонетическая форма крестильного имени Матвей (через Матфий — Матфа — Маша) или же вариант имени Машар (от арабского «машар» — «место собрания», «место поклонения»). В таком случае фамилия образована по стандартной русской модели: имя Машар + суффикс принадлежности -ев (сын Машара). Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или «ш»: Машар — Машарев, а со временем, под влиянием произношения, «а» в суффиксе могла перейти в «у» (явление аканья и последующей фиксации на письме). Подобные переходы — «Макаров» в «Макуров» — встречаются в говорах.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — происхождение от прозвища Машара. В южнорусских и украинских говорах «машара» — это нечто вроде «мешок», «котомка», а также могло означать неуклюжего или медлительного человека (ср. «махать», «машарить» — делать неловко). В этом случае фамилия — прозвищная, указывающая на характер или внешность предка.

Географически фамилия Машаруев тяготеет к регионам, где сильны были смешанные русско-тюркские контакты, или к югу России. Фактор редкого окончания «-уев» (а не «-аев») может говорить о том, что фамилия фиксировалась в среде, где письменная норма была слаба, а произношение играло решающую роль. Поскольку фамилия не принадлежала к дворянским или купеческим родам (в родословных книгах она не встречается), её носителями были крестьяне или однодворцы — свободные земледельцы на южных окраинах государства. Однозначного ответа на вопрос о корне нет, но этимологически наиболее убедительной выглядит версия от личного имени Машар, которое со временем обросло типичным русским фамильным суффиксом.