Фамилия Машкенов — редкий пример, где тюркская основа соединилась с русским патронимическим суффиксом. Разберём её по частям, чтобы понять, кем могли быть предки.

Корень «Машкен» — сложный. Первая часть, «Маш», скорее всего, восходит к тюркскому имени Маш, которое могло быть сокращением от Мухаммед (в тюркской огласовке — Мамет, Маш). Вторая часть, «кен», в тюркских языках (казахском, татарском, башкирском) имеет значение «широкий», «просторный», но чаще выступает как суффикс, образующий прилагательные и имена со значением «обладающий чем-то» или «подобный». Соединившись, «Машкен» могло означать либо «подобный Машу», либо быть топонимическим прозвищем — «человек из местности Машкен» (такие названия встречаются в Казахстане и Средней Азии). Менее вероятна, но возможна версия, что «кен» — это искажённое тюркское «кан» («кровь», «род»), тогда фамилия означала бы «из рода Маша».

Русский суффикс «-ов» указывает на то, что фамилия оформлялась по стандартной модели русских фамилий XIX века: «чей?» — «Машкенов», то есть сын Машкена. Это типично для фамилий, которые возникали у татарских, башкирских, казахских мурз и простых людей при переходе в русское подданство или при записи в метрические книги. Географически фамилия Машкенов чаще всего встречается в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане — регионах, где веками жили тюркские народы, а русская администрация записывала их имена на свой лад.

Таким образом, предок носителя фамилии Машкенов — скорее всего, тюркского происхождения, носивший имя или прозвище Машкен. При крещении или при получении официального статуса его дети стали записываться как Машкеновы. Фамилия сохранила редкую словообразовательную цепочку, где тюркский корень не обрусел до неузнаваемости, а остался почти в исходном виде.