Фамилия Масутова — женская форма мужской фамилии Масутов, и её происхождение напрямую связано с именем или прозвищем, лёгшим в основу. Скорее всего, перед нами патронимическая фамилия, образованная от тюркского имени Масут. Это имя, в свою очередь, восходит к арабскому «мас’уд» — «счастливый», «благополучный». В таком случае Масутов — буквально «сын Масутова», а Масутова — «жена или дочь Масутова».

В русской ономастике модель на -ов/-ев — одна из самых распространённых; она типична для фамилий, возникших в центральной России и Поволжье, где издавна жили тюркские народы. Поскольку имя Масут (и его варианты Масут, Масгут) встречается у татар, башкир и других тюркоязычных групп, предки Масутовых с высокой вероятностью были выходцами из этой среды. Фамилия могла закрепиться за крещёными татарами или за служилыми людьми из татарских родов, которые переходили на русскую службу.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от прозвища Масут, связанного с диалектным словом. В некоторых тюркских говорах «масут» означало «упрямый», «настойчивый». Тогда фамилия отражала бы не имя, а характер конкретного человека — родоначальника. Однако имя Масут как личное имя встречается в исторических записях гораздо чаще, поэтому первая версия выглядит убедительнее.

Фамилия Масутова не относится к числу массовых. Она сосредоточена в регионах с традиционно высоким процентом татарского и башкирского населения: в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Встречается и в других частях России, но реже, что указывает на миграции носителей в XX веке.

С точки зрения словообразования фамилия Масутова ничем не примечательна — это стандартная модель, зато основа неожиданно редка для русского уха: имя Масут не перешло в массовый обиход, в отличие от, скажем, Расула или Саида. Поэтому Масутова — пример фамилии, которая сохранила в себе древнее арабское имя через тюркское посредство, и в этом её ценность для семейной истории.