Фамилия Мацькова — женская форма фамилии Мацьков. В русской традиции такие фамилии образованы от мужского имени или прозвища с помощью суффикса -ов, а окончание -а указывает на принадлежность женщине (дочери или жене Мацькова). Сама же основа — Мацьк- — это, скорее всего, уменьшительная форма от имени Матвей.

Если разобрать цепочку: полное имя Матвей в просторечии и диалектах часто сокращали до Матя, Матюха, Матюша, а в некоторых говорах — до Маць. Суффикс -к- в русских именованиях придаёт уменьшительно-ласкательный оттенок, так что Мацько — это «маленький Матвей» или, что вероятнее, ласковое обращение к сыну или младшему родственнику. В украинской и белорусской среде форма Мацько могла быть самостоятельным прозвищем или даже именем, но для русской фамилии исходное имя Матвей — самый прямой и частый вариант.

Вероятно, предок носителя фамилии был человеком по имени Мацько, то есть Матвеем. Фамилии на -ов, как правило, получали крестьяне и посадские люди в XV–XVII веках при переписях, когда нужно было закрепить за семьёй прозвище главы дома. Географически фамилия Мацьков (и Мацькова) встречается в центральных и южных регионах России, а также в пограничных с Белоруссией и Украиной областях — там, где «аканье» и смягчение согласных были нормой. Это не дворянская фамилия: суффикс -ов- указывает на непривилегированное сословие, а основа-уменьшительное имя — на бытовую, деревенскую среду.

Есть и более редкая версия: в некоторых говорах «мацька» или «мацько» могло означать «маленький», «мелкий» (от общеславянского корня со значением «малый»), но она слабо подтверждена. Скорее всего, перед нами типичная «отчество» от имени, которое вышло из употребления как самостоятельное, но сохранилось в фамилии.